مهجوریت قرآن به معنای متروک ماندن آموزهها و اعراض از مفاهیم آن از سوی مخاطبان است. امام خمینی با اعتقاد به جامعیت همهجانبة قرآن، برآن است که ابعاد سیاسی و اجتماعی آن عملاً در سطح وسیعی از جوامع مسلمان مهجور واقع شده است. از نظر ایشان هم مسلمانان و هم بیگانگان در مهجوریت قرآن نقش دارند و مهمترین زمینهها و عوامل مهجوریت قرآن عبارتند از: مهجوریت اهل بیت(ع)، بسنده کردن به ظواهر قرآن، تحجر و خشکذهنی، ناکارآمد جلوه دادن قرآن در حوزههای سیاسی و اجتماعی از سوی دشمنان، ارائة تفاسیر ناصواب و سلیقهای از قرآن، ستمپیشگی حاکمان و زمامداران، ازخودبیگانگیو خودباختگی فرهنگی.
Isolation of the Quran means lack of attention to its doctrines and teachings by the addressees. Having faith in the all-comprehensiveness of the Quran, Imam Khomeini maintained that political and social aspects of the teachings of the Quran did not receive the due attention of the Muslim societies. In his viewpoints, both Muslims and non-Muslims were responsible for the isolation of the Quran. Some of the factors behind the isolation of the Quran in his viewpoints are: lack of due attention to the Household of the Holy Prophet (PBUH) of Islam, confining one to the appearances of the Quran, ossification and fanaticism, enemies attempts to project Quran ineffective in social and political fields, incorrect interpretations of the Quran, oppression of the rulers and cultural alienation and lack of confidence.